| http://dbpedia.org/ontology/abstract
|
Rekonstruksi nenek moyang adalah upaya unt … Rekonstruksi nenek moyang adalah upaya untuk menentukan nenek moyang bersama dari sejumlah individu atau populasi. Metode ini sangat penting dalam bidang filogenetika yang mengkaji hubungan evolusi antar populasi atau spesies hingga ke nenek moyang mereka.tau spesies hingga ke nenek moyang mereka.
, إعادة بناء الأسلاف (تُسمى أيضًا رسم السمات … إعادة بناء الأسلاف (تُسمى أيضًا رسم السمات أو تحسين السمات) هي استقراء الخصائص المحددة للأفراد (أو السكان) عودةً بالزمن إلى أسلافهم المشتركين. يعد تطبيقًا هامًا في علم الوراثة العرقي، وإعادة بناء ودراسة العلاقات التطورية بين الأفراد أو السكان أو الأنواع وأسلافهم. في سياق علم الأحياء التطوري، يمكن استخدام إعادة بناء الأسلاف لاستعادة أنواع مختلفة من الحالات الشخصية السلفية للكائنات الحية التي عاشت منذ ملايين السنين. تتضمن هذه الحالات التسلسل الجيني (إعادة بناء تسلسل الأسلاف)، وتسلسل الأحماض الأمينية للبروتين، وتكوين المجموع المورثي (ترتيب الجينات)، وسمات قابلة للقياس (النمط الظاهري)، والنطاق الجغرافي لسكان أو أنواع الأسلاف (إعادة بناء نطاق الأسلاف). يعد هذا الأمر مرغوبًا فيه لأنه يسمح لنا بفحص أجزاء من أشجار تطور السلالات المقابلة للماضي البعيد، وتوضيح التاريخ التطوري للأنواع في الشجرة. نظرًا لاختلاف التسلسلات الجينية الحديثة في الأساس عن التسلسلات القديمة، قد يحدد الوصول إلى التسلسلات القديمة الاختلافات والكائنات الأخرى التي يمكن أنها نشأت من تلك التسلسلات. بالإضافة إلى التسلسلات الجينية، قد يحاول المرء تتبع عملية تغيير سمة معينة إلى أخرى، مثل تحول الزعانف إلى أرجل. تشمل التطبيقات غير البيولوجية إعادة بناء مفردات أو صوتيات اللغات القديمة، والخصائص الثقافية للمجتمعات القديمة مثل النقولات الشفوية أو ممارسات الزواج. تعتمد إعادة بناء الأسلاف على نموذج إحصائي واقعي بدرجة كافية للتطور لاستعادة حالات الأسلاف بدقة. تستخدم هذه النماذج المعلومات الجينية التي حُصل عليها بطرق مثل علم الوراثة العرقي لتحديد المسار الذي سلكه التطور ومتى وقعت الأحداث التطورية. بغض النظر عن مدى دقة النموذج في تقريب التاريخ التطوري الفعلي، تضعف قدرة الفرد على إعادة بناء السلف مع زيادة الوقت التطوري بين ذلك السلف وأحفاده المرصودة. بالإضافة إلى ذلك، تكون نماذج التطور الأكثر واقعية حتمًا أكثر تعقيدًا ويصعب حسابها. اعتمد التقدم في مجال إعادة بناء الأسلاف بشكل كبير على النمو الأسي لقوة الحوسبة وما يصاحب ذلك من تطوير لخوارزميات حسابية فعالة (مثل خوارزمية البرمجة الديناميكية لإعادة بناء القيمة العليا لدالة الإمكان المشتركة لتسلسلات الأجداد). غالبًا ما تُطبق طرق إعادة بناء الأسلاف على شجرة تطور سلالات معينة استُنتجت من نفس البيانات. رغم كون النهج مناسب، يتمثل عيبه في أن نتائجه تتوقف على دقة شجرة تطور السلالات الواحدة. في المقابل، يدعو بعض الباحثين إلى اتباع الاستدلال البايزي الأفضل من ناحية الحوسبة والذي يفسر عدم اليقين في إعادة بناء الأشجار من خلال تقييم عمليات إعادة بناء الأسلاف على العديد من الأشجار. إعادة بناء الأسلاف على العديد من الأشجار.
, Ancestral reconstruction (also known as Ch … Ancestral reconstruction (also known as Character Mapping or Character Optimization) is the extrapolation back in time from measured characteristics of individuals (or populations) to their common ancestors. It is an important application of phylogenetics, the reconstruction and study of the evolutionary relationships among individuals, populations or species to their ancestors. In the context of evolutionary biology, ancestral reconstruction can be used to recover different kinds of ancestral character states of organisms that lived millions of years ago. These states include the genetic sequence (ancestral sequence reconstruction), the amino acid sequence of a protein, the composition of a genome (e.g., gene order), a measurable characteristic of an organism (phenotype), and the geographic range of an ancestral population or species (ancestral range reconstruction). This is desirable because it allows us to examine parts of phylogenetic trees corresponding to the distant past, clarifying the evolutionary history of the species in the tree. Since modern genetic sequences are essentially a variation of ancient ones, access to ancient sequences may identify other variations and organisms which could have arisen from those sequences. In addition to genetic sequences, one might attempt to track the changing of one character trait to another, such as fins turning to legs. Non-biological applications include the reconstruction of the vocabulary or phonemes of ancient languages, and cultural characteristics of ancient societies such as oral traditions or marriage practices. Ancestral reconstruction relies on a sufficiently realistic statistical model of evolution to accurately recover ancestral states. These models use the genetic information already obtained through methods such as phylogenetics to determine the route that evolution has taken and when evolutionary events occurred. No matter how well the model approximates the actual evolutionary history, however, one's ability to accurately reconstruct an ancestor deteriorates with increasing evolutionary time between that ancestor and its observed descendants. Additionally, more realistic models of evolution are inevitably more complex and difficult to calculate, but also required to obtain more accurate reconstructions. Progress in the field of ancestral reconstruction has relied heavily on the exponential growth of computing power and the concomitant development of efficient computational algorithms (e.g., a dynamic programming algorithm for the joint maximum likelihood reconstruction of ancestral sequences). Methods of ancestral reconstruction are often applied to a given phylogenetic tree that has already been inferred from the same data. While convenient, this approach has the disadvantage that its results are contingent on the accuracy of a single phylogenetic tree (i.e., a biased phylogenetic tree due to ignoring recombination can bias the reconstructed ancestral sequences ). In contrast, some researchers advocate a more computationally intensive Bayesian approach that accounts for uncertainty in tree reconstruction by evaluating ancestral reconstructions over many trees.ancestral reconstructions over many trees.
|
| http://dbpedia.org/ontology/thumbnail
|
http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Parsimony.Anc.png?width=300 +
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageExternalLink
|
http://www.evolution.rdg.ac.uk/BayesTraits.html +
, http://beast.community/ +
, http://carmelab.huji.ac.il/software/EREM/erem.html%23input +
, http://www.evotutor.org/LemmonLab/Software.html +
, http://www.geneorder.org/server.php +
, http://www.reelab.net/lagrange/configurator/index +
, https://web.archive.org/web/20160303234954/http:/www.simmap.com/pgs/inputfiles.html +
, http://mnh.scu.edu.cn/soft/blog/RASP/ +
, http://decipher.codes +
, https://cran.r-project.org/web/packages/ape/index.html +
, https://web.archive.org/web/20151102035801/http:/www.simmap.com/ +
, http://badger.duq.edu/ +
, https://web.archive.org/web/20140604021518/http:/mesquiteproject.org/mesquite_folder/docs/mesquite/manual.html +
, http://fastml.tau.ac.il/ +
, http://mesquiteproject.org/packages/cartographer/ancestral.html +
, http://compgen.bscb.cornell.edu/phast/ +
, http://www.zoology.ubc.ca/prog/diversitree/ +
, http://hyphy.org/w/index.php/Main_Page +
, http://badger.duq.edu/manual2/input.html +
, http://www.rossnes.org/phyrex/ +
, http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html +
, http://www.iro.umontreal.ca/~csuros/gene_content/count.html +
, https://web.archive.org/web/20150910050917/http:/ancestors.bioinfo.uqam.ca/ancestorWeb/ +
, https://web.archive.org/web/20151208053710/http:/www.lillo.org.ar/phylogeny/VIP/index.htm +
, https://web.archive.org/web/20151211193105/http:/carmelab.huji.ac.il/software.html +
, https://github.com/MiguelArenas/protasr +
, https://www.cs.cmu.edu/~ckingsf/software/parana/ +
, http://www.megasoftware.net +
, http://mrbayes.sourceforge.net/ +
, http://paleogenomics.irmacs.sfu.ca/ANGES/index.html +
, http://www.geneorder.org/LikelihoodAnalysis/GeneOrderFormat.php +
, http://www.phytools.org/eqg2015/asr.html +
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageID
|
6383817
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageLength
|
118092
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageRevisionID
|
1118258829
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageWikiLink
|
http://dbpedia.org/resource/Taxon +
, http://dbpedia.org/resource/Origin_of_life +
, http://dbpedia.org/resource/Vaccine +
, http://dbpedia.org/resource/Phrynosoma +
, http://dbpedia.org/resource/Stable_distribution +
, http://dbpedia.org/resource/GNU_Free_Documentation_License +
, http://dbpedia.org/resource/Camarhynchus +
, http://dbpedia.org/resource/Species_distribution +
, http://dbpedia.org/resource/Chromosomal_inversion +
, http://dbpedia.org/resource/Sequence_alignment +
, http://dbpedia.org/resource/Amino_acid +
, http://dbpedia.org/resource/HIV +
, http://dbpedia.org/resource/Gene_duplication +
, http://dbpedia.org/resource/Statistical_model +
, http://dbpedia.org/resource/Cladistics +
, http://dbpedia.org/resource/Occam%27s_razor +
, http://dbpedia.org/resource/Emile_Zuckerkandl +
, http://dbpedia.org/resource/GNU_Lesser_General_Public_License +
, http://dbpedia.org/resource/MEGA%2C_Molecular_Evolutionary_Genetics_Analysis +
, http://dbpedia.org/resource/Bayesian_Inference +
, http://dbpedia.org/resource/Moore%27s_law +
, http://dbpedia.org/resource/Algorithm +
, http://dbpedia.org/resource/Phylogenetic_comparative_methods +
, http://dbpedia.org/resource/Peptide_sequence +
, http://dbpedia.org/resource/Upland_chorus_frog +
, http://dbpedia.org/resource/Common_descent +
, http://dbpedia.org/resource/Substitution_model +
, http://dbpedia.org/resource/Folivore +
, http://dbpedia.org/resource/Homology_%28biology%29 +
, http://dbpedia.org/resource/Rodent +
, http://dbpedia.org/resource/Phylogeography +
, http://dbpedia.org/resource/Proto-Indo-European_language +
, http://dbpedia.org/resource/Deletion_%28genetics%29 +
, http://dbpedia.org/resource/Bayesian_statistics +
, http://dbpedia.org/resource/Ancestral_sequence_reconstruction +
, http://dbpedia.org/resource/UPGMA +
, http://dbpedia.org/resource/Epidemic +
, http://dbpedia.org/resource/Proto-language +
, http://dbpedia.org/resource/BSD_licenses +
, http://dbpedia.org/resource/Maximum_parsimony +
, http://dbpedia.org/resource/Apache_License +
, http://dbpedia.org/resource/Insectivore +
, http://dbpedia.org/resource/Molecular_evolution +
, http://dbpedia.org/resource/Hong_Kong +
, http://dbpedia.org/resource/Alfred_Sturtevant +
, http://dbpedia.org/resource/Computational_complexity_theory +
, http://dbpedia.org/resource/Phenotype +
, http://dbpedia.org/resource/Nucleic_acid_sequence +
, http://dbpedia.org/resource/Cognate +
, http://dbpedia.org/resource/Markov_chain +
, http://dbpedia.org/resource/Maximum_likelihood +
, http://dbpedia.org/resource/Selection_%28biology%29 +
, http://dbpedia.org/resource/Phylogenetic_tree +
, http://dbpedia.org/resource/Horned_lizard +
, http://dbpedia.org/resource/Models_of_DNA_evolution +
, http://dbpedia.org/resource/Protein +
, http://dbpedia.org/resource/Metropolis_hastings +
, http://dbpedia.org/resource/Walter_M._Fitch +
, http://dbpedia.org/resource/Nasal_vowel +
, http://dbpedia.org/resource/Finch +
, http://dbpedia.org/resource/Creative_Commons_license +
, http://dbpedia.org/resource/Ornstein-Uhlenbeck_process +
, http://dbpedia.org/resource/Markov_chain_Monte_Carlo +
, http://dbpedia.org/resource/Tree_%28data_structure%29 +
, http://dbpedia.org/resource/DNA_sequencing +
, http://dbpedia.org/resource/Catalyst +
, http://dbpedia.org/resource/Evolutionary_biology +
, http://dbpedia.org/resource/Genetic_sequence +
, http://dbpedia.org/resource/West_Africa +
, http://dbpedia.org/resource/Brownian_motion +
, http://dbpedia.org/resource/Protein_tertiary_structure +
, http://dbpedia.org/resource/Vicariance +
, http://dbpedia.org/resource/Lichen +
, http://dbpedia.org/resource/Felsenstein%27s_tree-pruning_algorithm +
, http://dbpedia.org/resource/Guangdong +
, http://dbpedia.org/resource/Diversification_rates +
, http://dbpedia.org/resource/Viral_plaque +
, http://dbpedia.org/resource/Ancient_language +
, http://dbpedia.org/resource/Genome +
, http://dbpedia.org/resource/Skeletal_muscle +
, http://dbpedia.org/resource/Python_%28programming_language%29 +
, http://dbpedia.org/resource/DNA +
, http://dbpedia.org/resource/Seed_predation +
, http://dbpedia.org/resource/Tree_traversal +
, http://dbpedia.org/resource/Cyrtandra_%28plant%29 +
, http://dbpedia.org/resource/Prior_probability +
, http://dbpedia.org/resource/Union_%28set_theory%29 +
, http://dbpedia.org/resource/GNU_General_Public_License +
, http://dbpedia.org/resource/Transversion +
, http://dbpedia.org/resource/Muscles +
, http://dbpedia.org/resource/Lizards +
, http://dbpedia.org/resource/Karyotype +
, http://dbpedia.org/resource/Transposable_element +
, http://dbpedia.org/resource/Phylogenetics +
, http://dbpedia.org/resource/NP-hard +
, http://dbpedia.org/resource/Intersection_%28set_theory%29 +
, http://dbpedia.org/resource/Software_license +
, http://dbpedia.org/resource/Joseph_Felsenstein +
, http://dbpedia.org/resource/Transition_%28genetics%29 +
, http://dbpedia.org/resource/Bayes%27_theorem +
, http://dbpedia.org/resource/R_%28programming_language%29 +
, http://dbpedia.org/resource/Phylogeny +
, http://dbpedia.org/resource/Evolution +
, http://dbpedia.org/resource/Galapagos_Islands +
, http://dbpedia.org/resource/Free_software_license +
, http://dbpedia.org/resource/Frederick_Sanger +
, http://dbpedia.org/resource/Drosophila_pseudoobscura +
, http://dbpedia.org/resource/Binary_tree +
, http://dbpedia.org/resource/Comparative_genomics +
, http://dbpedia.org/resource/Most_recent_common_ancestor +
, http://dbpedia.org/resource/Dynamic_programming +
, http://dbpedia.org/resource/Influenza_A_virus_subtype_H5N1 +
, http://dbpedia.org/resource/Deep_sequencing +
, http://dbpedia.org/resource/Caniformia +
, http://dbpedia.org/resource/Indel +
, http://dbpedia.org/resource/Species +
, http://dbpedia.org/resource/Phrynosomatidae +
, http://dbpedia.org/resource/Bayesian_inference +
, http://dbpedia.org/resource/Synteny +
, http://dbpedia.org/resource/Linus_Pauling +
, http://dbpedia.org/resource/Continuous-time_Markov_chain +
, http://dbpedia.org/resource/Rabies_virus +
, http://dbpedia.org/resource/Posterior_probability +
, http://dbpedia.org/resource/Geospiza +
, http://dbpedia.org/resource/Empirical_Bayes_method +
, http://dbpedia.org/resource/Hypothesis +
, http://dbpedia.org/resource/Enzyme_promiscuity +
, http://dbpedia.org/resource/Darwin%27s_Finches +
, http://dbpedia.org/resource/Horizontal_gene_transfer +
, http://dbpedia.org/resource/Placentalia +
, http://dbpedia.org/resource/T7_phage +
, http://dbpedia.org/resource/Stable_process +
, http://dbpedia.org/resource/Permutation +
, http://dbpedia.org/resource/Coevolution +
, http://dbpedia.org/resource/Viviparity +
, http://dbpedia.org/resource/Heterotachy +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Evolutionary_biology +
, http://dbpedia.org/resource/File:Phylogeny_of_7_regional_strains_of_Drosophila_pseudoobscura.png +
, http://dbpedia.org/resource/Theodoseus_Dobzhansky +
, http://dbpedia.org/resource/Homologous_recombination +
, http://dbpedia.org/resource/File:MC2State.png +
, http://dbpedia.org/resource/File:Parsimony.Anc.png +
, http://dbpedia.org/resource/File:BMOUplot.png +
, http://dbpedia.org/resource/File:KState1Param.png +
, http://dbpedia.org/resource/Biogeography +
, http://dbpedia.org/resource/Bayesian_Evolutionary_Analysis_by_Sampling_Trees +
, http://dbpedia.org/resource/File:Asymmetrical5State.png +
, http://dbpedia.org/resource/Brain_size +
|
| http://dbpedia.org/property/wikiPageUsesTemplate
|
http://dbpedia.org/resource/Template:Short_description +
, http://dbpedia.org/resource/Template:Center +
, http://dbpedia.org/resource/Template:Academic_peer_reviewed +
, http://dbpedia.org/resource/Template:Main +
, http://dbpedia.org/resource/Template:Portal +
, http://dbpedia.org/resource/Template:Reflist +
|
| http://purl.org/dc/terms/subject
|
http://dbpedia.org/resource/Category:Evolutionary_biology +
|
| http://purl.org/linguistics/gold/hypernym
|
http://dbpedia.org/resource/Extrapolation +
|
| http://www.w3.org/ns/prov#wasDerivedFrom
|
http://en.wikipedia.org/wiki/Ancestral_reconstruction?oldid=1118258829&ns=0 +
|
| http://xmlns.com/foaf/0.1/depiction
|
http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Phylogeny_of_7_regional_strains_of_Drosophila_pseudoobscura.png +
, http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Asymmetrical5State.png +
, http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Parsimony.Anc.png +
, http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/BMOUplot.png +
, http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/KState1Param.png +
, http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/MC2State.png +
|
| http://xmlns.com/foaf/0.1/isPrimaryTopicOf
|
http://en.wikipedia.org/wiki/Ancestral_reconstruction +
|
| owl:sameAs |
http://id.dbpedia.org/resource/Rekonstruksi_nenek_moyang +
, http://www.wikidata.org/entity/Q4752568 +
, http://dbpedia.org/resource/Ancestral_reconstruction +
, https://global.dbpedia.org/id/4QJnU +
, http://ar.dbpedia.org/resource/%D8%A5%D8%B9%D8%A7%D8%AF%D8%A9_%D8%A8%D9%86%D8%A7%D8%A1_%D8%A7%D9%84%D8%A3%D8%B3%D9%84%D8%A7%D9%81 +
, http://rdf.freebase.com/ns/m.0g38fs +
|
| rdfs:comment |
Ancestral reconstruction (also known as Ch … Ancestral reconstruction (also known as Character Mapping or Character Optimization) is the extrapolation back in time from measured characteristics of individuals (or populations) to their common ancestors. It is an important application of phylogenetics, the reconstruction and study of the evolutionary relationships among individuals, populations or species to their ancestors. In the context of evolutionary biology, ancestral reconstruction can be used to recover different kinds of ancestral character states of organisms that lived millions of years ago. These states include the genetic sequence (ancestral sequence reconstruction), the amino acid sequence of a protein, the composition of a genome (e.g., gene order), a measurable characteristic of an organism (phenotype), and the geograph an organism (phenotype), and the geograph
, إعادة بناء الأسلاف (تُسمى أيضًا رسم السمات … إعادة بناء الأسلاف (تُسمى أيضًا رسم السمات أو تحسين السمات) هي استقراء الخصائص المحددة للأفراد (أو السكان) عودةً بالزمن إلى أسلافهم المشتركين. يعد تطبيقًا هامًا في علم الوراثة العرقي، وإعادة بناء ودراسة العلاقات التطورية بين الأفراد أو السكان أو الأنواع وأسلافهم. في سياق علم الأحياء التطوري، يمكن استخدام إعادة بناء الأسلاف لاستعادة أنواع مختلفة من الحالات الشخصية السلفية للكائنات الحية التي عاشت منذ ملايين السنين. تتضمن هذه الحالات التسلسل الجيني (إعادة بناء تسلسل الأسلاف)، وتسلسل الأحماض الأمينية للبروتين، وتكوين المجموع المورثي (ترتيب الجينات)، وسمات قابلة للقياس (النمط الظاهري)، والنطاق الجغرافي لسكان أو أنواع الأسلاف (إعادة بناء نطاق الأسلاف). يعد هذا الأمر مرغوبًا فيه لأنه يسمح لنا بفحص أجزاء من أشجار تطور السلالات المقابلة للماضي البعيد، وتوضيح التاريخ التطوري للأنواع في الشجرة. نظرًيح التاريخ التطوري للأنواع في الشجرة. نظرً
, Rekonstruksi nenek moyang adalah upaya unt … Rekonstruksi nenek moyang adalah upaya untuk menentukan nenek moyang bersama dari sejumlah individu atau populasi. Metode ini sangat penting dalam bidang filogenetika yang mengkaji hubungan evolusi antar populasi atau spesies hingga ke nenek moyang mereka.tau spesies hingga ke nenek moyang mereka.
|
| rdfs:label |
Ancestral reconstruction
, Rekonstruksi nenek moyang
, إعادة بناء الأسلاف
|
