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Http://dbpedia.org/resource/Serine hydrolase
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http://dbpedia.org/ontology/abstract Une hydrolase à sérine est une hydrolase cUne hydrolase à sérine est une hydrolase constituant l'une des plus grandes familles d'enzymes, qui compte environ 200 membres et représente 1 % des gènes du protéome humain. Cette famille d'enzymes est caractérisée par la présence d'un résidu nucléophile de sérine dans son site actif intervenant dans l'hydrolyse des substrats. Le mécanisme réactionnel fait intervenir la formation d'un intermédiaire réactionnel acyle-enzyme à l'aide de ce résidu de sérine, suivie par la saponification de cet intermédiaire induite par l'eau ou l'anion hydroxyde, ce qui régénère l'enzyme. Contrairement aux autres résidus de sérine, qui n'interviennent pas dans la catalyse de la réaction, le résidu nucléophile de sérine est généralement activé par un relai de proton impliquant un résidu acide, par exemple d'aspartate ou de glutamate, et un résidu basique, généralement d'histidine, bien qu'il existe des variations de ce mécanisme.'il existe des variations de ce mécanisme. , Serine hydrolases are one of the largest kSerine hydrolases are one of the largest known enzyme classes comprising approximately ~200 enzymes or 1% of the genes in the human proteome. A defining characteristic of these enzymes is the presence of a particular serine at the active site, which is used for the hydrolysis of substrates. The hydrolysis of the ester or peptide bond proceeds in two steps. First, the acyl part of the substrate (the acid part of an ester or the part of a peptide ending in a carboxyl group) is transferred to the serine, making a new ester or amide bond and releasing the other part of the substrate (the alcohol of an ester or the part of the peptide ending in an amino group) is released. Later, in a slower step, the bond between the serine and the acyl group is hydrolyzed by water or hydroxide ion, regenerating free enzyme. Unlike other, non-catalytic, serines, the reactive serine of these hydrolases is typically activated by a involving a catalytic triad consisting of the serine, an acidic residue (e.g. aspartate or glutamate) and a basic residue (usually histidine), although variations on this mechanism exist. Superfamilies of serine hydrolases includes: * Serine proteases, including trypsin, chymotrypsin, and subtilisin * Extracellular lipases, including pancreatic lipase, hepatic lipase, gastric lipase, endothelial lipase, and lipoprotein lipase * Intracellular lipases, including hormone sensitive lipase, monoacylglycerol lipase, adipose triglyceride lipase, and diacylglycerol lipase * Cholinesterases, including acetylcholinesterase and butyrylcholinesterase * Small molecule thioesterases, including fatty acid synthase and the acyl-CoA thioesterases * Some phospholipases, including phospholipase A2 and platelet activating factor acetylhydrolase * Protein and glycan hydrolases, including protein phosphate methylesterase 1, acyloxyacyl hydrolase and sialic acid acetylesterase * Some amidases, including fatty acid amide hydrolase * Some peptidases, including dipeptidyl peptidase 4, fibroblast activation protein, and prolylendopeptidasectivation protein, and prolylendopeptidase , La superfamília hidrolasa serina (en anglèLa superfamília hidrolasa serina (en anglès: serine hydrolase) és una de les famílies més grans d'enzims conegudes, consta aproximadament de 200 enzims o l'1% dels gens en el proteoma humà. Una característica que defineix la superfamília és la presència d'una serina en un lloc actiu nucleofílic que es fa servir per a la hidròlisi de substrats bioquímics. Aquesta família inclou: , incloent-hi tripsina, quimotripsina, i ; lipases extracel·lulars, incloent-hi les lipases pancreàtiques, hepàtiques, gàstriques, endotèliques i lipoprotiques; lipases intracel·lulars; colinesterases; tioesterases; algunes fosofolipases; hidrolases de proteïna i ; algunes ; i algunes peptidases.oteïna i ; algunes ; i algunes peptidases.
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