| http://dbpedia.org/ontology/abstract
|
El motivo adyacente de protoespaciador (de … El motivo adyacente de protoespaciador (del inglés Protospacer adjacent motif (PAM)) es una secuencia de ADN de 2-6 pares de bases inmediatamente después de la secuencia de ADN dirigida por la nucleasa Cas9 en el sistema inmune adaptativo bacteriano CRISPR.PAM es un componente del virus o plásmido invasor, pero no es un componente del locus CRISPR bacteriano. Cas9 no se unirá con éxito o escindirá la secuencia de ADN objetivo si no es seguido por la secuencia PAM. PAM es un componente de orientación esencial (que no se encuentra en el genoma bacteriano) que distingue a la bacteria en si del material de ADN, evitando así que el locus CRISPR sea atacado y destruido por nucleasas.PR sea atacado y destruido por nucleasas.
, Protospacer adjacent Motif (PAM, ‚Vorabstandshalter-angrenzendes Motiv‘ bzw. Protospacer-Nachbarmotiv) ist in der Biochemie ein Sequenzmotiv von DNA, an das die Endonucleasen vom Typ Cas binden.
, A protospacer adjacent motif (PAM) is a 2– … A protospacer adjacent motif (PAM) is a 2–6-base pair DNA sequence immediately following the DNA sequence targeted by the Cas9 nuclease in the CRISPR bacterial adaptive immune system. The PAM is a component of the invading virus or plasmid, but is not found in the bacterial host genome and hence is not a component of the bacterial CRISPR locus. Cas9 will not successfully bind to or cleave the target DNA sequence if it is not followed by the PAM sequence. PAM is an essential targeting component which distinguishes bacterial self from non-self DNA, thereby preventing the CRISPR locus from being targeted and destroyed by the CRISPR-associated nuclease.stroyed by the CRISPR-associated nuclease.
, El MAP o el motiu adjacent al protoespaiad … El MAP o el motiu adjacent al protoespaiador, en anglès protospacer adjacent motif (PAM), és una seqüència d'ADN, d'entre 1 i 5 nucleòtids, que està a continuació de la seqüència diana de la nucleasa Cas9 del sistema immunitari adaptatiu bacterià CRISPR. MAP és un component del plàsmid o virus invasiu, però no és un component del locus CRISPR. La nucleasa Cas9 no s'unirà al ADN o el tallarà correctament si a continuació no hi ha present la seqüència MAP. MAP permet distingir l'ADN propi del que no ho és, evitant que el locus CRISPR sigui tallat per la nucleasa. Els locus de CRISPR contenent espaiadors o "spacers" (ADN viral inserit en el locus CRISPR) que en el sistema immune adaptatiu de tipus II van ser creats a partir d'ADN invasor de virus o plàsmids (anomenats protospacers). En una reinfecció, Cas9 s'uneix al tracrRNA: crRNA que guia Cas9 a la seqüència del potoespaiador invasor. Però Cas9 no serà capaç de tallar a menys que a continuació hi hagi la seqüència MAP. La seqüència MAP canònica és 5'-NGG-3', on N és qualsevol nucleobase seguida per dos guanines. La canònica s'associa amb la Cas9 de Streptococcus pyogenes. La no canònica 5'-NGA-3' pot ser molt eficient pels humans, però l'eficiencia varia amb la localització del genoma. Hi ha diferents MAP segons l'organisme del qual prové la Cas9 o si ha estat modificada. S'han fet intents de crear una Cas9 que reconegui diferents MAPs per augmentar l'habilitat de l'edició genètica en qualsevol lloc del genoma.ció genètica en qualsevol lloc del genoma.
, Il Motivo adiacente al Protospacer (Protos … Il Motivo adiacente al Protospacer (Protospacer adjacent motif, in sigla PAM) è una sequenza di 2-6 paia di basi immediatamente successiva alla sequenza di DNA identificata dalla nucleasi Cas9 nel sistema immunitario adattativo dei batteri mediato dal sistema CRISPR. PAM è il componente genico del plasmide o virus invadente, ma non è un componente del locus CRISPR del batterio. Se non seguita da nessuna sequenza PAM infatti, la sequenza di DNA da clivare/modificare non sarà né legata né riconosciuta da Cas9. PAM è un bersaglio essenziale che permette di distinguere il DNA-self dei batteri quello non-self. È infatti assente nei genomi batterici e ciò previene che la nucleasi Cas riconosca e distrugga il locus CRISPR.Cas riconosca e distrugga il locus CRISPR.
|
| http://dbpedia.org/ontology/thumbnail
|
http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/PAMs_of_different_CRISPR_nucleases.svg?width=300 +
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageExternalLink
|
https://www.addgene.org/CRISPR/guide/%23PAM +
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageID
|
43732972
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageLength
|
12100
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageRevisionID
|
1107506240
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageWikiLink
|
http://dbpedia.org/resource/File:PAMs_of_different_CRISPR_nucleases.svg +
, http://dbpedia.org/resource/Streptococcus_thermophilus +
, http://dbpedia.org/resource/CRISPR +
, http://dbpedia.org/resource/DNA +
, http://dbpedia.org/resource/Francisella_novicida +
, http://dbpedia.org/resource/Streptococcus_pyogenes +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Genome_editing +
, http://dbpedia.org/resource/Treponema_denticola +
, http://dbpedia.org/resource/Leptotrichia_shahii +
, http://dbpedia.org/resource/Cas9 +
, http://dbpedia.org/resource/CRISPR/Cpf1 +
, http://dbpedia.org/resource/Genome_editing +
, http://dbpedia.org/resource/Adaptive_immune_system +
, http://dbpedia.org/resource/GUIDE-Seq +
, http://dbpedia.org/resource/Neisseria_meningitidis +
, http://dbpedia.org/resource/Nuclease +
, http://dbpedia.org/resource/Pyrimidine +
, http://dbpedia.org/resource/Trans-activating_crRNA +
, http://dbpedia.org/resource/Guanine +
, http://dbpedia.org/resource/Directionality_%28molecular_biology%29 +
, http://dbpedia.org/resource/Base_pair +
, http://dbpedia.org/resource/Bacteria +
, http://dbpedia.org/resource/Nucleobase +
, http://dbpedia.org/resource/Guide_RNA +
|
| http://dbpedia.org/property/wikiPageUsesTemplate
|
http://dbpedia.org/resource/Template:Reflist +
|
| http://purl.org/dc/terms/subject
|
http://dbpedia.org/resource/Category:Genome_editing +
|
| http://purl.org/linguistics/gold/hypernym
|
http://dbpedia.org/resource/Sequence +
|
| http://www.w3.org/ns/prov#wasDerivedFrom
|
http://en.wikipedia.org/wiki/Protospacer_adjacent_motif?oldid=1107506240&ns=0 +
|
| http://xmlns.com/foaf/0.1/depiction
|
http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/PAMs_of_different_CRISPR_nucleases.svg +
|
| http://xmlns.com/foaf/0.1/isPrimaryTopicOf
|
http://en.wikipedia.org/wiki/Protospacer_adjacent_motif +
|
| owl:sameAs |
http://ca.dbpedia.org/resource/Motiu_adjacent_al_protoespaiador +
, http://www.wikidata.org/entity/Q18345122 +
, http://es.dbpedia.org/resource/Motivo_adyacente_de_protoespaciador +
, http://dbpedia.org/resource/Protospacer_adjacent_motif +
, http://de.dbpedia.org/resource/Protospacer_Adjacent_Motif +
, http://it.dbpedia.org/resource/Motivo_adiacente_al_Protospacer +
, https://global.dbpedia.org/id/mzV3 +
, http://rdf.freebase.com/ns/m.011smn6h +
|
| rdfs:comment |
Protospacer adjacent Motif (PAM, ‚Vorabstandshalter-angrenzendes Motiv‘ bzw. Protospacer-Nachbarmotiv) ist in der Biochemie ein Sequenzmotiv von DNA, an das die Endonucleasen vom Typ Cas binden.
, A protospacer adjacent motif (PAM) is a 2– … A protospacer adjacent motif (PAM) is a 2–6-base pair DNA sequence immediately following the DNA sequence targeted by the Cas9 nuclease in the CRISPR bacterial adaptive immune system. The PAM is a component of the invading virus or plasmid, but is not found in the bacterial host genome and hence is not a component of the bacterial CRISPR locus. Cas9 will not successfully bind to or cleave the target DNA sequence if it is not followed by the PAM sequence. PAM is an essential targeting component which distinguishes bacterial self from non-self DNA, thereby preventing the CRISPR locus from being targeted and destroyed by the CRISPR-associated nuclease.stroyed by the CRISPR-associated nuclease.
, El MAP o el motiu adjacent al protoespaiad … El MAP o el motiu adjacent al protoespaiador, en anglès protospacer adjacent motif (PAM), és una seqüència d'ADN, d'entre 1 i 5 nucleòtids, que està a continuació de la seqüència diana de la nucleasa Cas9 del sistema immunitari adaptatiu bacterià CRISPR. MAP és un component del plàsmid o virus invasiu, però no és un component del locus CRISPR. La nucleasa Cas9 no s'unirà al ADN o el tallarà correctament si a continuació no hi ha present la seqüència MAP. MAP permet distingir l'ADN propi del que no ho és, evitant que el locus CRISPR sigui tallat per la nucleasa.locus CRISPR sigui tallat per la nucleasa.
, El motivo adyacente de protoespaciador (de … El motivo adyacente de protoespaciador (del inglés Protospacer adjacent motif (PAM)) es una secuencia de ADN de 2-6 pares de bases inmediatamente después de la secuencia de ADN dirigida por la nucleasa Cas9 en el sistema inmune adaptativo bacteriano CRISPR.PAM es un componente del virus o plásmido invasor, pero no es un componente del locus CRISPR bacteriano. Cas9 no se unirá con éxito o escindirá la secuencia de ADN objetivo si no es seguido por la secuencia PAM. PAM es un componente de orientación esencial (que no se encuentra en el genoma bacteriano) que distingue a la bacteria en si del material de ADN, evitando así que el locus CRISPR sea atacado y destruido por nucleasas.PR sea atacado y destruido por nucleasas.
, Il Motivo adiacente al Protospacer (Protos … Il Motivo adiacente al Protospacer (Protospacer adjacent motif, in sigla PAM) è una sequenza di 2-6 paia di basi immediatamente successiva alla sequenza di DNA identificata dalla nucleasi Cas9 nel sistema immunitario adattativo dei batteri mediato dal sistema CRISPR. PAM è il componente genico del plasmide o virus invadente, ma non è un componente del locus CRISPR del batterio. Se non seguita da nessuna sequenza PAM infatti, la sequenza di DNA da clivare/modificare non sarà né legata né riconosciuta da Cas9.on sarà né legata né riconosciuta da Cas9.
|
| rdfs:label |
Motivo adiacente al Protospacer
, Protospacer Adjacent Motif
, Protospacer adjacent motif
, Motivo adyacente de protoespaciador
, Motiu adjacent al protoespaiador
|
